Sumber air baku dapat berasal dari sumber air permukaan seperti sungai, danau, dan waduk, atau air tanah. Air ini kemudian digunakan sebagai air masuk untuk instalasi pengolahan air. Kualitas air baku dapat bervariasi secara signifikan karena faktor-faktor seperti curah hujan, erosi permukaan, polusi dari sumber sekitarnya, perubahan musim, pertumbuhan alga, dan mineralisasi air tanah. Air tersebut mengandung sedimen tersuspensi, bahan organik alami, nitrogen amonia, dan berbagai mikroorganisme. Selama periode tertentu, mungkin juga terdapat jejak alga dan besi mangan dalam air. Kualitas air baku secara langsung memengaruhi jumlah bahan kimia yang digunakan dalam proses pengolahan dan kondisi operasi peralatan pengolahan. Oleh karena itu, kualitas air baku merupakan faktor penting dalam seluruh proses pemurnian air. Jika kualitas air baku tidak konsisten, hal itu akan meningkatkan beban pengolahan pada tahap selanjutnya seperti koagulasi, filtrasi, dan disinfeksi, dan bahkan dapat memengaruhi keamanan air yang dihasilkan pada akhir proses.